Таки ожидается два фильма по мотивам сериала и один новый, т.е. скорее всего продолжение.
www.animenewsnetwork.com/news/2011-11-08/madoka...

Но радоваться стоит или негодовать? Во-первых, 13 серий для Мадоки было если не мало, то по крайней мере не много. А тут фильмы, пусть даже и два. Да и продолжение какое-то, к законченному сериалу.
Хотя, учитывая, что над этим работают всё те же люди, скорее стоит надеяться и ждать.